Перейти к содержимому


Фотография
- - - - -

Встраивание в ДНК

днк интеркаляция нуклеотид

  • Авторизуйтесь для ответа в теме
Сообщений в теме: 14

#11 химик-философ

химик-философ
  • Пользователи
  • 3 034 сообщений

Отправлено 18 Февраль 2015 - 08:01

Оч специфично, так что азот может стаять там где должен. Однако встречал работу где атом кислорода замен на два атома углерода с сохранением структуры ДНК. Ссылку поищу.

J. Am. Chem. Soc. 2008. 130, 8762-8768



#12 ksanf

ksanf
  • Пользователи
  • 395 сообщений

Отправлено 26 Март 2015 - 12:27

Вот еще оказывается есть подобные препараты: 

http://www.5rik.ru/b...best-16690.html

Идоксуридин (Керецид) — синтетический аналог тимидина. Препарат встраивается в молекулу ДНК, в связи с чем подавляет репликацию некоторых ДНК-содержащих вирусов. 

http://www.abc-gid.r...str/show/29445/

"Идоксуридин, очень близкий тимидину, ингибирует тимидилфосфорилазу и специфические ДНК-полимеразы, необходимые для встраивания тимидина в вирусную ДНК; встраивается в вирусную ДНК вместо тимидина, в результате этого ДНК становится дефектной и неспособной инфицировать или разрушать ткань, а вирус не может размножаться."

Но толком, т.е. однозначно, нигде не сказано, что происходит с ДНК:

- или происходит обрыв репликации в результате невозможности прицепить следующий дезоксинуклеотид к растущей цепи,

- или данная репликация доходит до конца, но нарушается следующая репликация, вроде как информация не считывается,

- или не идет транскрипция в соответствующих местах - там где встроен препарат.


Сообщение отредактировал ksanf: 26 Март 2015 - 12:29


#13 Corn

Corn
  • Пользователи
  • 179 сообщений

Отправлено 28 Март 2015 - 10:44

Спасибо, ksanf, весьма интересно.

Немного поковырял инфу по этому идоксуридину. Вот что нашлось:

1. РЛС: "После фосфорилирования внутри клеток встраивается в ДНК вируса, которая становится дефектной и более подвержена повреждению; после нарушений транскрипции образуются дефектные вирусные белки. Активность в основном направлена против ДНК-содержащих вирусов (простого герпеса и ветрянки)."

2. Проведены МЯ-тесты на разных человеческих хромосомах, результаты здесь:

Прикрепленный файл  MN_Idoxuridine.pdf   111,45К   219 скачиваний
Поэтому применяют его только конъюнктивально, и сразу же отменяют если не помогает.
 

Меня всё же интересуют теоретические аспекты такого "встраивания": есть ли возможность предсказать, насколько вероятно оно для конкретной молекулы?

Да и обычная интеркаляция предсказывается как-нибудь кроме "ну посмотри на эту конденсированную полиароматику - конечно, она будет интеркалировать"?

Может софт какой кто посоветует для расчета энергий взаимодействия малых молекул с ДНК?


Сообщение отредактировал Corn: 28 Март 2015 - 10:45


#14 Corn

Corn
  • Пользователи
  • 179 сообщений

Отправлено 17 Январь 2018 - 22:20

Если кому интересно, тут недавно вышла статья ни много ни мало в Nature. В кодон ДНК засунули чужеродную пару псевдонуклеотидов с совсем непохожими на природные азотистыми основаниями (блин, да они даже почти не азотистые!). И не просто засунули, а сделали так, чтобы пошла транскрипция и декодирование этого кодона в непротеиногенную аминокислоту, которая нормально вошла в состав белка.

Link: https://cen.acs.org/...-unnatural.html

Article: https://www.nature.c...les/nature24659

По последней ссылке во вкладке "Figures" можно посмотреть структурки использованных "азотистых оснований". Мелко, зато бесплатно  :al:



#15 Odding

Odding
  • Пользователи
  • 115 сообщений

Отправлено 17 Январь 2018 - 23:15

лет 15 назад, давно дело было, точно не помню, извините...

одна моя коллега хвасталась что ей удалось вставить кофеин в ДНК, если память не изменяет на место А

девушка была не только симпатичная, но и очень умная, я склонен ей верить.






Количество пользователей, читающих эту тему: 0

0 пользователей, 0 гостей, 0 скрытых пользователей

Яндекс.Метрика