Перейти к публикации
Форум химиков на XuMuK.ru

Рекомендованные сообщения

Подскажите, пожалуйста, где и как посмотреть базу данных всех структур, установленных методом рентгеноструктурного анализа, для неорганических соединений?

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Прям всех вообще? В англоязычной Вики есть статья, посвященная кристаллографическим банкам данных. В ней, в частности, есть ссылки на самые крупные, например, на ICSD, COD, AMCSD. Но, некоторые из них платные, т.е. у Вашей научной организации должнен быть куплен доступ к этим базам данным (как, например, в случае ICSD). У нас было так: в библиотеке был зал, в котором стояли компьютеры, с которых можно было рыться, например, в CSD. Там был установлен соответствующий софт, и с их IPшников был открыт доступ к данной кристаллографическому банку структур.


При этом обратите внимание, что некоторые структуры могут присутствовать сразу в нескольких базах данных, а некоторые могут присутствовать только в одной. Универсальной базы данных, среди приведённых, нет, поэтому Вы могли бы уточнить интересующий Вас вопрос.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Спасибо за ссылки.

Интересуют анионные комплексы палладия, с органическим фрагментом. Хочу понять в каких случаях органический фрагмент работает как лиганд, а в каких как катион; а так же какие структуры уже известны. В Кембриджской базе данных не нашел, так только орг., быть может это среди неорг?

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Ну Вы посмотрите на COD (она открытая и с достаточно простым поиском). Там, вроде, и элементорганика и чистая неорганика есть. Может, что найдете. :ay:

А как Вы понимаете, что окружение Pd -- это лиганд или катион. Имхо, без карт электронной плотности и Бейдеровского анализа зарядов и связей сказать сложно...

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Ну Вы посмотрите на COD (она открытая и с достаточно простым поиском). Там, вроде, и элементорганика и чистая неорганика есть. Может, что найдете. :ay:

А как Вы понимаете, что окружение Pd -- это лиганд или катион. Имхо, без карт электронной плотности и Бейдеровского анализа зарядов и связей сказать сложно...

Она только простые структуры принимает. Рисую структуру с пиридином, выдает ошибку.

Нарисована ковалентная связь - лиганд. Не нарисована - катион.

Похоже тужа не все введено. Комплексы Кукушкина не выдает.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Она только простые структуры принимает. Рисую структуру с пиридином, выдает ошибку.

Ну можно вручную как-то поотбирать структуры (скажем, поэлементно). Организация поиска -- тоже весьма нетривиальная химическая задача, а это волонтёрский научный продукт, поэтому многое может уступать крупным академическим организациям.

 

Нарисована ковалентная связь - лиганд. Не нарисована - катион.

Эта связь в просмотрщиках, строго говоря, не имеет физического смысла. Как Вам известно, связь рисуется в них, если расстояние между двумя атомами меньше суммы их атомных радиусов (например, этих), домноженных на некую константу (обычно по дефолту это 1.1-1.2). Её можно подкручивать в зависимости от пожеланий левой пятки правой ноги. Поэтому, будте аккуратнее с таким определением. :rolleyes:

Похоже тужа не все введено. Комплексы Кукушкина не выдает.

COD наполняется на свободной основе (т.е. люди делают структуру, а после присылают её сами туда для включения). Поэтому, да, Вы правы, там много чего нет.

Изменено пользователем madschumacher

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Присоединяйтесь к обсуждению

Вы можете опубликовать сообщение сейчас, а зарегистрироваться позже. Если у вас есть аккаунт, войдите в него для написания от своего имени.
Примечание: вашему сообщению потребуется утверждение модератора, прежде чем оно станет доступным.

Гость
Ответить в тему...

×   Вставлено в виде отформатированного текста.   Вставить в виде обычного текста

  Разрешено не более 75 эмодзи.

×   Ваша ссылка была автоматически встроена.   Отобразить как ссылку

×   Ваш предыдущий контент был восстановлен.   Очистить редактор

×   Вы не можете вставить изображения напрямую. Загрузите или вставьте изображения по ссылке.

Загрузка...

  • Сейчас на странице   0 пользователей

    Нет пользователей, просматривающих эту страницу.

×
×
  • Создать...