базы данных

[nordrussian]

Здравствуйте Уважаемые ученые.

У меня возник вот такой вопрос,у нас кафедра купила кластер и теперь хочет просчитывать реакции, конформации и др. для того чтобы заново не просчитываь некоторые вещества заново(трехмерную структуру, энергию и т.д.) требуются файл chemm office или любой другой с этим веществом где все уже просчитано. Т.е. как бы файл данных чтобы мы могли загрузить в кластер этот файл а дальше просчитать что нам нужно присоединяя к нему лиганды и имитируя воздействия. (3d структура). есть ли какие нибудь ресурсы где можно скачать эти файлы, или базы данных по ним. (вот некоторые вещества:

5-ht2a рецептор

5-ht3

5-ht4)

был на сайте iuphar и rcsb.org но как пользоваться не разобрался.

 

Извините, что может быть непонятно объяснил.

Я буду благодарен за любую информацию по данной теме.

Спасибо.

[Ося]

Не понятно, что за вещества. Попробуйте нарисовать их и рассчитать в ACDLabs

[Emilius Paulus]

С интернет-ресурсов существует несколько выходов на базы данных MedLine. Наверное, самый известный проект из вышеозначенных - сайт NCBI:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov

Возможно, стоит также посмотреть БД по протеинам на двух следющих ресурсах:

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

http://www.ebi.ac.uk/pdbe/

И, в конце концов, ежели ничего полезного там не найдёте, вопросы по QSAR и базам данных можно задать на ChemPort'е и AnChem'е.