Дестабилизация амидной связи

[MsKarleon]

Может ли поливинилкапролактам (ПВК) каким-либо образом "стягивать" электронную плотность с амидной связи бензоил-аргинин-паранитроанилида (BAPNA)?

[arkansas]

Вероятно, стоило бы задать вопрос в "Органической химии". На мой дилетантский взгляд, лактамный азот вполне мог бы садиться неподеленной парой на LUMO-орбиталь карбонильного углерода и тем самым дестабилизировать амидную связь. За счет электростатических взаимодействий такой процесс должен бы быть более вероятен в районе изоэлектрической точки амида.

[chemlab]

Сначала надо бы описать наблюдаепмое явление, а потом придумывать теории...

[MsKarleon]

Уважаемый, chemlab! К сожалению, Вы не правы. Явление уже есть, а одним из его возможных объяснений могла стать дестабилизация данной связи.

Изменено 20 Мая, 2011 в 15:34 пользователем MsKarleon

[chemlab]

Уважаемый, chemlab! К сожалению, Вы не правы. Явление уже есть, а одним из его возможных объяснений могла стать дестабилизация данной связи.

Я еще ничего не утверждал, поэтому не могу быть правым или левым. Я просто прошу Вас описать наблюдаемое явление, иначе нет повода для обсуждения.

[MsKarleon]

каким образом введение в буферную систему поливинилкапролактама (ПВК) активирует ферменты? в частности, увеличивает активность трипсина на 40-60 процентов. ПВК-обратимоосаждаемый термочувствительный водорастворимый полимер, обратимо выпадает в осадок при нагреве более 32 градусов С. В научных статьях есть данные о том, что ПВК стабилизирует многие ферменты, но каким образом-внятного ответа нет.

 

 

Я прочел немало статей и диссертаций по данной проблеме и везде основной упор делают на то, что в среде ПВК трипсин изменяет надмолекулярную структуру более выгодным для взаимодействия с субстратом образом. Но никто не задается вопросом о том, что происходит с субстратом!? В своей работе я использую фермент BAPNA, трипсин гидролизует амидную связь с образованием п-нитроанилина. Теоретически, скорость гидролиза может увеличиваться при дестабилизации данной амидной связи. Может ли ПВК "стягивать" электронную плотность с амидной связи субстрата?

Изменено 20 Мая, 2011 в 21:07 пользователем MsKarleon