Объясните пожалуйста стратегию решения
Чтобы получить мутантный белок Cas9 аспирант взял плазмиду pVIP1 с фрагментом гена Cas9 и высокоточную ДНК-полимеразу Q5 (NEB) для сайт-направленного мутагенеза. После ПЦР с праймерами, содержащими тринуклеотидную замену, лигирования и трансформации клеток E. coli были получены плазмиды c пяти разных колоний. Проведите множественное выравнивание секвенограмм
Задача. Какую аминокислотную замену хотел произвести аспирант? Последовательность из трех нуклеотидов, которая закодирована в праймере.
Праймеры, использованные для получения плазмид 1, 2, 3, 4
Primer1_F 5'-TATGATTAAGGCGCGTGGTCATTTTTTGATTGAG-3'
Primer1_R 5'-TGCGCTAAGGCCAAATAG-3
Праймеры, использованные для получения плазмиды 5
Primer2_F 5'-ATATGATTAAGGCGCGTGGTCATTTTTTGATTGAGG-3'
Primer2_R 5'-GCGCTAAGGCCAAATAGA-3'
Праймер, использованный для секвенирования
Праймер T3-промотора 5'-GCAATTAACCCTCACTAAAGG-3'
