"Молекулярные отпечатки пальцев" биологически активных соединений

[Eridu]

Да, есть такое. К нам в лаб на тестирование устанавливали такое ПО. Не прижилось, стереохимию оно не учитывает, но не прижилось из-за не полезности. Обычно поступаем иначе. Синтезируем или выделяем соединение лидер, навешиваем на него различные группы, затем решая матричное уровненные строим корреляции многочлена дескрипторов - биологическая активность. Исходя из установленной закономерности подбираем соединение с нужными значениями дескрипторов.

Спасибо за Ваш ответ. Действительно, данная методика, к сожалению, не учитывает стереохимию исследуемых соединений. В этом ее большой недостаток. Если Вас не затруднит, мне хотелось бы уточнить название  указанного программного обеспечения.

[Arkadiy]

На глаз определить ничего невозможно при фармакофорном поиске ( где и применяется метод "молекулярных отпечатков пальцев", т.к. исходные соединения могут очень сильно отличаться друг от друга( например, относиться к разным классам органических соединений), но иметь схожие геометрические параметры, определяемые через нахождение погдрафов  в молекулярных графах сравниваемых соединений. Кроме того, на основании молекулярного графа составляются топологические инварианты(индескы), которые также позволяют упростить поиск по базе структур  веществ обладающих схожей биологической активностью.

Для этого всего лишь нужно иметь соответствующее образование и опыт работы. ничего страшного в разных кассах органических веществ в принципе нет.

[химик-философ]

Спасибо за Ваш ответ. Действительно, данная методика, к сожалению, не учитывает стереохимию исследуемых соединений. В этом ее большой недостаток. Если Вас не затруднит, мне хотелось бы уточнить название  указанного программного обеспечения.

Не могу сказать, так как чел, кто работал с программой в отпуске.

[Eridu]

Не могу сказать, так как чел, кто работал с программой в отпуске.

Спасибо  за ответ.