Триптический перевар, масс-спектрометрия/МС-секвенирование белков

[kisayquri]

я сгенерировал данные с помощью масс-спектра maldi tof-tof после триптического расщепления.

так как maldi генерирует однозарядные (обычно) фрагменты. каждый фрагмент на 1 m/z превышает его истинную молекулярную массу из-за добавленного протонного противоиона.

я секвенировал один фрагмент, поместил его в prot param expasy. это дает мне ту же молекулярную массу, что и m/z. разве он не должен быть ниже m/z?

спасибо.

[Angry_Biotechnologist]

Если я правильно понял вопрос:

Все зависит от того сколько зарядов несет на себе фрагмент. Например, фрагмент с весом в 100, несущий 2 заряда будет иметь m/z 50. У вас получается несется один заряд? Тобиш m/z должет быть равен мол. массе.