Фармацевтическая химия изучает химические свойства лекарственных веществ, зависимость фармакологических свойств от химической структуры (например если метильная группа тут - снотворное, а если два гидроксила тут и там - уже анальгетик), способы и методы анализа лекарственных веществ, как химического (аналитическая химия), так и приборного (колориметрия, хроматография и т.п) Знание ФХ нужно для специалистов по контролю качества лексредств (контрольно-аналитические лаборатории или Центры контроля качества), для разработчиков новых лексредств и т.п.
Фармакогнозия изучает лекарственные растения и лекарственное растительное сырьё во всех проявлениях - виды лек. растений, места их произрастания, правила сбора и заготовки лекарственного растительного сырья, химический состав лекарственных растений, способы химического, физико-химического и биологического (например по внешнему виду, микроскопическим признакам) анализа лексырья и т.п,