mariapetrova38445 Опубликовано 21 Декабря, 2020 в 12:42 Поделиться Опубликовано 21 Декабря, 2020 в 12:42 (изменено) Здравствуйте! Возникла проблема при расчете физико-химических параметров (дипольный момент, поляризуемость, площадь поверхности, площадь поверхности на плоскость, липофильность, объем и энергия сольватации) с помощью программы HyperChem. Действую по следующему алгоритму: рисую молекулу, нажимаю Build->Add Hydrogens. Затем Setup->Semi-empirical->PM3. Потом Compute-> Geometry Optimization-> Polak-Ribiere (0.1 kcal/mol и 300 maximum cycles). Прикрепила скрин с молекулой 2-(1Н-1,2,4-триазол-1-илметил)фенола, расчет идет не до конца, не пишет внизу "YES" и вид молекулы после оптимизации очень смущает (разрозренные по всему экрану связи). Поэтому невозможно перейти по вкладке Properties и найти дипольный момент, а во вкладке QSAR properties приведены данные, которые очень сильно отличаются от данных, полученных для похожих веществ. Изменено 21 Декабря, 2020 в 12:54 пользователем mariapetrova38445 Ссылка на комментарий
Рекомендуемые сообщения
Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь
Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий
Создать аккаунт
Зарегистрируйте новый аккаунт в нашем сообществе. Это очень просто!
Регистрация нового пользователяВойти
Уже есть аккаунт? Войти в систему.
Войти