mariapetrova38445 Опубликовано 23 Декабря, 2020 в 13:06 Поделиться Опубликовано 23 Декабря, 2020 в 13:06 Здравствуйте! Возникла проблема при расчете физико-химических параметров (дипольный момент, поляризуемость, площадь поверхности, площадь поверхности на плоскость, липофильность, объем и энергия сольватации) с помощью программы HyperChem. Действую по следующему алгоритму: рисую молекулу, нажимаю Build->Add Hydrogens. Затем Setup->Semi-empirical->PM3. Потом Compute-> Geometry Optimization-> Polak-Ribiere (0.1 kcal/mol и 300 maximum cycles). Прикрепила скрин с молекулой 2-(1Н-1,2,4-триазол-1-илметил)фенола (скрин 1), расчет идет не до конца, не пишет внизу "YES" и вид молекулы после оптимизации очень смущает (разрозренные по всему экрану связи)(скрин 2), либо просто не досчитывает до конца (скрин 3). Поэтому невозможно перейти по вкладке Properties и найти дипольный момент, а во вкладке QSAR properties приведены данные, которые очень сильно отличаются от данных, полученных для похожих веществ. Ссылка на комментарий
Рекомендуемые сообщения
Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь
Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий
Создать аккаунт
Зарегистрируйте новый аккаунт в нашем сообществе. Это очень просто!
Регистрация нового пользователяВойти
Уже есть аккаунт? Войти в систему.
Войти