какие участки цепи могут иметь ?-конфигурацию

[finly]

Из печени был получен полипептид АЛА-ГЛИ-ГЛИ-ПРО-ЦИС-ТРЕ-ТИР-ФЕН-ЦИС-АЛА-СЕР-ПРО-ГЛИ-ГИС-АЛА-ГЛУ. какие участки в полипептидной цепи могут иметь ?-конфигурацию? Где находятся места крутого изгиба молекулы? в каком месте могут образовываться нековалентные связи с соседними участками полипептидной цепи?

[neinkognito]

Из печени был получен полипептид АЛА-ГЛИ-ГЛИ-ПРО-ЦИС-ТРЕ-ТИР-ФЕН-ЦИС-АЛА-СЕР-ПРО-ГЛИ-ГИС-АЛА-ГЛУ. какие участки в полипептидной цепи могут иметь ?-конфигурацию? Где находятся места крутого изгиба молекулы? в каком месте могут образовываться нековалентные связи с соседними участками полипептидной цепи?

 

Некоторые аминокислоты препятствуют свертыванию цепи в ?-спираль, и в месте их расположения непрерывность ? -спирали нарушается. К ним относятся Pro и Hyp (в нем атом азота служит частью жесткой кольцевой структуры, и вращение вокруг связи N — СO становится невозможным). Поэтому в месте расположения этих АМК образуется жесткий изгиб. Кроме того аминокислоты с заряженными или объемными R-группами, дестабилизируют электростатически или механически препятствуют формированию ? - спирали. Например, Arg, Asp, Glu, Gly, Lys, Ile, Ser, Thr.

Способствуют формированию остальные АМК- Ala, Asn, Cys, Gln, His, Leu, Met, Phe, Тrp, Туr и Val.