Linkey

Думаю, вы ошибаетесь. Приведу в тему ещё цитату, кажется её сказал биолог Ричард Докинз: у древних людей чувство благодарности было эквивалентом нынешних денег. Понимаете о чём речь?

Я говорю совсем о другом. Когда люди живут в группе где все друг друга знают, человеку невыгодно обижать соседей: об этом узнают остальнрые, его репутация упадёт, что перевесит для него выгоду от его плохого поступка. Если не ошибаюсь, формально низкая продолжительность жизни была обусловлена высокой детской смертностью, может быть распространённым инфантицидом (убивали детей т.е. еды бы на всех не хватило).

Я склонен верить в т.н. "саванную теорию счастья": первобытные люди (охотники-собиратели) были гораздосчастливее нас, поскольку они жили группами по 150 человек, где все друг друга знают; и человеку было невыгодно вести себя плохо - в этом случае страдала его репутация и остальные его наказывали. Посмотрел видео антрополога Станислава Дробышевского, где он подтвердил что охотники-собиратели были счастливее нас: https://youtu.be/lyTbO8Z1MTA https://vk.com/video-64302028_456245068 Дробышевский говорит, что есть какие-то маркеры уровня стресса на костях, и по костями первобытных людей видно, что у них уровень стресса был в 10 раз меньше нашего. Характерно, что 8 лет назад Дробышевский говорил что первобытные люди жили хуже нас: https://youtu.be/BeUyJZCp_14 https://vk.com/video-3156562_456245758 Это видео от 2017 года. Видимо за это время он подразобрался в теме и поменял взгляды.

Продолжу если можно. Предположим, вы хотите узнать энергию реакции разложения молекулы бензола на три молекулы ацетилена. Делайте так (после перезапуска программы или очистки через меню "File/Clear"): 1) Нажмите Edit/Add fragment, в окне выберите Molecules/Rings/Benzene, после этого кликните на главный экран программы, где чёрное. Добавится молекула бензола C6H6; 2) Выберите Compute/Geometry optimization + frequency job. Слева появятся новые меню; 3) Удалите четыре атома углерода и четыре атома водорода, чтобы осталась только искажённая молекула ацетилена C2H2. Для удаления атомов можно кликать на атоме левой кнопкой мыши, после этого нажимать del. Или можно удалить все атомы и выбрать Edit/Add fragment/Molecules/Simple compounds/C2H2; 4) Выберите Compute/Geometry optimization + frequency job; 5) Теперь у вас слева есть расчёт энергии бензола и энергии ацетилена. Кликайте на меню Frequencies (который вверху) слева, раскрывайте его плюсом, далее кликайте на подменю Single point geometry, далее нажмите Abstract в главном окне программы, и далее скопируйте в Clipboard полную энергию (которая примерно -15.9); 6) Далее выберите Tools/Simple utilities/Calculate the energy of a reaction. Под Reactants нажмите Paste, энергия вставится в окно; 7) Не закрывая окно для расчёта энергий реакций, вернитесь во Frequencies слева (уже нижний), раскройте его, перейдите в Single point geometry, и скопируйте энергию ацетилена в главном окне в Abstract (примерно -5.2); 😎 Вернитесь в окно расчёта энергий реакции, и вставьте эту энергию под Products через Paste, также дважды кликните на плюс, чтобы Number стал равен трём. И нажимайте Calculate. Получится энергия реакции в газовой фазе около 680 кДж/моль.

Теряет протоны? Хм. А можете прислать мне пример файла с протонами? Можно в лс, или может тут или можно просто скопировать текст файла в пост.

Моя программа читает .mol файлы.

Прикрепляю корреляцию расчёта с экспериментом. Тут такие молекулы как толуол, ацетон, бутанон,пропен и пр. Но не надо слишком обнадёживаться этой картинкой, во-первых это DFT расчёт, а в Chemcraft сейчас используются более дешёвые полуэмпирические расчёты методом GFN (точность ниже). Во-вторых, в реальных исследованиях относительно больших органических молекул, обычно получается такая мешанина пиков в ИК спектре, что нормально интерпретировать это, отнести сигналы почти невозможно. Вот тут мне приятно что вы задали этот вопрос, поскольку я как раз это сделал. В моём примере выше, если вы посчитали ИК спектр скажем молекулы анилина, вы можете кликнуть на Frequencies слева, далее на меню внизу-слева, выбрать Calculate frequencies by Hessian, далее Set custom isotopes, выбрать ваши изотопы, и далее выбрать в меню Compute frequencies. Для меня было бы здорово, если окажется что снять экспериментальный спектр изотопозамещённого соединения не так сложно - в моей программе можно быстро обсчитать, как изотопозамещение сдвинет полосы в нём. Моя программа читает разные форматы, но полагаю xyz это всё-таки самый распространённый формат для "просто структур".

Если можно, я начну. Предлагаю скачать мою программу тут: https://www.chemcraftprog.com/download.html Итак, как, к примеру, быстро узнать характеристическую частоту группы NH2 в ИК спектре: Когда запустите программу, сделайте так: 1) Нажмите Edit/Add fragment, в окне выберите -R/C6H5, после этого кликните на главный экран программы, где чёрное. Добавится группа C6H5X; 2) Вернитесь в окно наверху и выберите -R/NH2. Далее кликните на прозрачном синем атоме (фиктивном). К бензольному кольцу добавится NH2. После этого можно закрыть окно сверху с фрагментами; 3) Выберите Compute/Optimize geometry/Perform optimization using Chemcraft optimizer (slow), подождите 1 минуту и нажмите Stop. Молекула соптимизируется; 4) Выберите Compute/Geometry optimization + frequency job. Слева появятся новые меню; 5) В иерархическом меню слева выберите Frequencies/Frequency 3510 (внизу). Будет видно что это колебательная мода группы NH2 (молекула задвигается); 6) Ещё слева выберите Frequencies/Show spectrum/IR intensities. Будет видно что эта частота имеет слабую интенсивность в спектре. Я могу сейчас оконфузиться, вообще я до этого не знал какая там частота у группы NH2; Chemcraft может показать, что у этой группы есть ещё колебания 346 и 1027, 1516 и другие. Т.е. вы видите, что получить таким образом информацию о веществе проще, чем даже гуглить. И тем более не нужно всё это выучивать заранее. Либо мою программу можно показывать для закрепления материала. Если студентов учат, например, sp гибридидации, пусть они запустят мою программу, посчитают какую-то молекулу и убедятся что всё верно.

Сорри, я на форуме редко пишу. Перенесите если так считаете.

Я выложил новую версию своей программы, в которой сделал свои квантовохимические расчёты, точнее интеграция с бесплатной программой xtb которая делает расчёты. Можно тут выложу ссылку на свою программу? Если что, уже выкладывал в предыдущей теме про масс-спектроскопию. Мою программу теперь можно использовать для преподавания компьютерной химии. Сейчас основной программой для таких задач является Hyperchem, но в России её трудно достать из-за санкций, а тут получается импортозамещение. Подскажите, можно ли куда-то написать, в какое-то министерство, с предложением заменить в учебной программе Hypechem на мою программу? Хочу рассказать идеи, как с такими программы можно внедрить новые подходы к преподаванию органической химии. Эти идеи родились из моего двадцатилетнего опыта занятий квантовой химией. Кратко, можно не забивать головы студентам обширными эмпирическими данными, а дать им мою программу на все случаи жизни, чтобы они могли за пару минут нарисовать молекулу и посчитать её свойства. Скажем такой пример: знаете ли вы характеристическую частоты группы –NH2 в ИК спектре? Если мне дадут выложить ссылку на мою программу, я покажу как примерно за 2 минуты построить структуру анилина, посчитать его ИК спектр и узнать эту частоту. Это получается проще чем даже гуглить, не говоря уже о предварительном выучивании. Предположим, студентам преподают какую-то концепцию в органической химии, вроде SP3 гибридизации. Очень полезно будет дать им мою программу, чтобы они нарисовали какой-нибудь этан, посчитали его свойства и убедились, что эта концепция верна.

Ну конечно абсурдная, но тем не менее занятная. Если есть любовник, может как раз требуется ещё тот кто всех содержит. "У женщины должно быть 4 зверя! Ягуар в гараже, Норка на плечах, Лев в постели и Осёл чтобы за всё это платил!"

Можно объяснить это например так, что женщинам хочется иметь отцом своих детей мужчину с самими лучшими генами, и часто это не тот мужчина, который является на данный момент официальным мужем. Соответственно она изменяет мужу с альфа-самцом и рожает детей от альфа-самца. "Муж - это тот кто содержит, а не тот кто тр..т" (с просторов интернета) "Отец - тот кто воспитал а не тот кто родил".

Давно увлекаюсь научпопом, в частности книгами про эволюционную психологию (этологию). Сейчас эта наука хорошо объясняет многие аспекты человеческой психики, например мужскую полигамность ревность. Самцы в природе склонны к полигамии, потому что полигамия им позволяет оставлять больше потомства, а наши гены программируют нас на то чтобы их распространять; у самок этого преимущества нет (родит всё равно только одного), поэтому они к многомужеству не склонны. Отсюда же берёт начало и ревность: если самец не ревнует свою самку, это увеличивает шансы что она родит ему чужое потомство и ему ещё придётся вкладывать ресурсы в его воспитание. Т.е. гены, которые программируют самцов на полигамию и ревность, в ходе естественного отбора вытесняют из генофонда гены, которые не программируют.

Я предлагаю не комбинации отрываемых атомов, а комбинации разрываемых связей. В программе можно будет указать, сколько связей можно разорвать. Точнее, возможно правильнее будет указать это число дважды - для одинарных связей и остальных. И будет галочка "Check recombination ions" или как это назвать, с ней программа будет обратно совмещать разорванные куски. Насколько сгодится такой алгоритм?

Ну платная. Дам название: Chemcraft, билд 709. Нагуглите. Программой можно бесплатно пользоваться в течении полгода, и я часто даю бесплатно ключ за помощь, подсказки по развитию программы.

Я сделал в своей программе утилиту для масс-спектрометристов: вы можете в ней ввести брутто-формулу, и программа построит масс-спектр молекулярного иона этой молекулы, с учётом стандартного распределения атомов по изотопам. Также вы можете ввести положение пика в вашем масс-спектре, и программа перечислит все возможные осколочные ионы, которые могут дать такой пик. Тут однако возникает проблема - если просто перечислять все брутто-формулы, программа выдаст много неправильных ионов, которые не могут образоваться в реальном масс-спектре. Как вариант решения этой проблемы, я сделал возможность отсеять все перегруппировочные ионы (тогда надо вводить не только брутто-формулу, но и структуру молекулы). Но мне сказали, что вообще перегруппировочные ионы встречаются в реальных спектрах довольно часто. И я думаю, что может быть оптимальным такой алгоритм: Программа берёт вашу молекулу, скажем эту: Далее программа перебирает все пары связей, удаляет их, и смотрит какие образуются осколки при перекомбинации фрагментов. Например, когда она в этой молекуле удаляет связи C1-C10 и C4-C20, образуются три фрагмента, которые могут дать такие варианты перегруппировочных ионов: И эти все варианты надо рассмотреть алгоритмом как возможные источники пика в масс-спектре. Сгодится такой алгоритм? Если я выложу тут ссылку на свою программу, или хотя бы напишу её название - это не будет считаться спамом?

Мне пришла в голову сделать в моей программе Chemcraft очень простую утилиту для расшифровки масс-спектров. Предположим, у вас есть пик в масс спектре и вы пока не знаете что его могло породить. Вы вводите брутто формулу предполагаемой молекулы, положение пика и погрешность положения пика; и программа перебирает все возможные осколки, которые могут образоваться при бомбардировке этой молекулы электронами, и отображает все варианты, которые могли дать этот пик. После этого для этих вариантов вы можете ещё указать уширение, и программа нарисует его теоретический масс спектр в виде графика. Конечно сейчас есть много утилит вроде xtb, которые сделают более серьёзный анализ и отбракуют невозможные осколки, но может моя утилита будет для кого-то удобнее. Более продвинутый вариант - если пользователь указывает не один пик а несколько, когда у масс-спектрометра высокая разрешающая способность. Тут видимо получается чуть более сложная задача - программа должна отбраковать осколки, которые дают пики (с учетом уширения т.е. разрешающей способности прибора), которых вы в вашем спектре не наблюдаете. Вам бы пригодилась такая утилита?

Спасибо за цитату, Оруэлл не разочаровал. В это связи, можно я чуть себя прорекламирую? Я написал рассказ "Чужая Земля", это тоже утопия: https://grandrienko.com/chuzhaya_zemlya.html Я не претендовал на научное понимание счастливого общества, скорее мой рассказ - философские размышления о нём и его проблемах, облачённые в литературную форму. Буду рад если прокомментируют.

Нашёл: https://en.wikipedia.org/wiki/Easterlin_paradox Автоперевод:

Я в одной книге читал про такой момент: хотя средний доход японской семьи в период с 1958 по 1987 год вырос в пять раз, мнение людей о собственном счастье совершенно не изменилось.

Я слышал что у психологов есть представление, что белая зависть - это завидовать тому, что человек имеет, а чёрная зависть - завидовать тому, что другой человек тебя в чём-то превосходит. Ещё психологи предлагают приём против зависти: надо представить, что вы получили не что-то отдельное, что есть у другого человека и что заставляет вас ему завидовать, а всю его жизнь целиком. Предположим, вы завидуете богатому человеку. Тогда представьте, что вы получили всю его жизнь целиком – с конфликтной любовницей, которая им манипулирует, с его врагами и конкурентами, может быть с детьми-наркоманами и так далее. Тогда станет видно, что оснований завидовать не настолько много, как казалось вначале.

Предлагаю обсудить идею, что эволюционная психология (этология) может дать научное объяснение природы зависти. Люди всегда сравнивают себя с окружающими: счастье определяется не абсолютным, а относительным уровнем комфорта. Грубо говоря, если все ездят на жигулях а один на мерседесе - ему хорошо, а если все ездят на мерседесах - это уже не то. Если уровень жизни окружающих выше чем наш - мы им завидуем, а если ниже - мы им сострадаем. Этот механизм придуман эволюцией, чтобы минимизировать проблему "зашкаливания" мозга из-за чрезмерных страданий и чрезмерных наслаждений. Т.е. без этого наши предки чаще умирали бы из-за перегрузок мозга, например когда стресс мешает организму функционировать. И вот, если мы видим человека которому живётся лучше чем нам - самим этим фактом он как бы делает нам больно, и может возникнуть даже агрессия с нашей стороны, желание сделать больно в ответ.

Ещё вопрос: не будут ли гнобить автора, если он в статье (в журнале) ссылается на препринт на chemarxiv, например собственный. Я не помню, чтобы в статьях, которые я читал по своей теме, кто-то ссылался на препринты.

А можно сначала выложить препринт, а потом удалить, если получится опубликоваться в журнале?