Надо подбирать конценрацию так чтобы не выпал. Минус способа (NH4)2SO4 + Ba(ClO4)2 = BaSO4↓ + 2NH4ClO4
1) трудно фильтровать сульфат бария (очень мелкий)
2) надо выпаривать (выкристализовывать) раствор для выделения NH4ClO4.
А если слить (по стехиометрии) концентрированные горячие растворы Ba(ClO4)2 и NH4NO3, и затем охладить до 0С, то сразу выпадет продукт - осадок перхлората аммония, который легко отделить (крупные кристаллы).