химические рекорды

[chemister2010]

В 29.12.2024 в 18:20, ZZZ7ZZZ сказал:

Это, можно сказать, уже сделано.

 

Ого! У вас компьютер справился? Все-таки оперирование очень большими объемами текста.

[ZZZ7ZZZ]

В 29.12.2024 в 21:24, chemister2010 сказал:

Все-таки оперирование очень большими объемами текста.

Всего лишь 248387328 символов? Вообще не проблема.

[chemister2010]

В 29.12.2024 в 18:28, ZZZ7ZZZ сказал:

Всего лишь 248387328 символов? Вообще не проблема.

И какой получился результат?

 

На всякий случай стоит проверить, есть ли в последовательности символы N.

Изменено 29 Декабря, 2024 в 15:33 пользователем chemister2010

[ZZZ7ZZZ]

В 29.12.2024 в 21:29, chemister2010 сказал:

И какой получился результат?

Мы сейчас о чём? Я о  подсчёте

В 29.12.2024 в 21:18, chemister2010 сказал:

Если заодно сделать подсчет числа замен и отметить какие нуклеотиды первый и последний

Число замен

A - 73600418
C - 51017014
G - 52064401
T - 71705495
Всего - 248387328

И тут "два путя" - реально заменить (это я не делал, займёт 20-30 минут), либо просто подсчитать, перемножив с табичными данными.

В общем, я просто посчитал количество символов, на "дезокси" я их не менял.

Изменено 29 Декабря, 2024 в 15:42 пользователем ZZZ7ZZZ

[chemister2010]

Итого, получилось, что название содержит 6 829 180 357 символов.

 

Спасибо! Вы рассчитали одно из самых длинных химических названий.

Изменено 29 Декабря, 2024 в 15:55 пользователем chemister2010

[chemister2010]

В 29.12.2024 в 18:37, ZZZ7ZZZ сказал:

В общем, я просто посчитал количество символов, на "дезокси" я их не менял.

 

А какой последний нуклеотид?

[ZZZ7ZZZ]

В 29.12.2024 в 21:56, chemister2010 сказал:

А какой последний нуклеотид?

Это конец файла

В 29.12.2024 в 21:06, ZZZ7ZZZ сказал:

...GTTAGGGTT

 

В 29.12.2024 в 21:50, chemister2010 сказал:

одно из самых длинных химических названий.

Продолжим? Полный геном считается как одно целое?

[chemister2010]

В 29.12.2024 в 18:59, ZZZ7ZZZ сказал:

Это конец файла

 

 

Итого, химическая формула одной цепи первой хромосомы человека:

C _{2 432 856 266} H _{3 052 353 433} N _{924 786 127} O _{1 129 901 571} P _{248 387 328}

[ZZZ7ZZZ]

В 29.12.2024 в 22:19, chemister2010 сказал:

Итого,

В общем, если взять целиком GCF_009914755.1_T2T-CHM13v2.0_genomic.fna, то начало у него
CACCCtaa...
конец ...agggttag
А по символам получается:
A - 923873689
C - 633691551
G - 636720375
T - 922989886
Всего - 3117275501

[chemister2010]

В 29.12.2024 в 18:59, ZZZ7ZZZ сказал:

Это конец файла

 

Продолжим? Полный геном считается как одно целое?

 

Полный геном, это отдельные хромосомы, т.е. отдельные молекулы.

Самая большая ДНК, которую я пока нашел это ДНК первой хромосомы омелы белой:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCA_963277665.1/

Она настолько здоровая, что им пришлось разделить сиквенс на 6 частей.

Там могут быть нераспознанные части.

Изменено 29 Декабря, 2024 в 16:34 пользователем chemister2010