Протеазы против прионов

[Loiso Pondohva]

Добрый день
И снова не совсем адекватные, но интересные вопросы. Как известно, лекарства от прионов ещё не придумали, хотя есть некоторые сподвижки в виде антител итд. 
Но прионы обладают невероятной химической стойкостью в силу своего строения. β-структуры все дела. Поэтому они стойки и к расщеплению большинством человеческих ферментов. Но что, если взять самую хоть сколько-то работающую протеазу, и подвергнуть её направленной эволюции? (Ну я имею ввиду той, за которую давеча нобелевку дали. Кучу раз мутируем фермент, замеряем активность, отбираем штаммы с наибольшей, снова мутируем...). Есть ли шансы через много поколений действительно получить работающий на прионы фермент? И тогда такой вопрос. Селективность протеаз. Они, насколько я знаю, несмотря на много типов, сильной выборочностью не отличаются к сожалению. Максимум их "селективности" - это расщепление до олигомеров, по определённой последовательности. Есть ли шанс сесть на 2 стула, и получить ещё и не опасную для тела протеазу? Или если оно будет хорошо расщеплять прионы, оно 100% будет расщеплять и всё остальное. Какие есть идеи по обходу этой проблемы?
//Вопрос чисто на порассуждать и подумать какие тут подводные камни и почему так ещё правда не делают, что можно улучшить и вообще надо ли. 

[Loiso Pondohva]

Я понимаю, что в плане селективности можно не мудрствовать лукаво, а использовать природный механизм активации профермента в нужном месте. Но как сделать это именно там, где нам надо? Нужен какой-то маркер приона, а этот маркер ещё привязать к триггеру для активации фермента (через кофермент, или отщепление куска цепи). 

[Аристотель]

Протеазы реагируют на убиквитин, убиквитин реагирует на специальный сигнальный сайт. Прион меняет свою конформацию до невозможного, каким образом его пометить? Убиквитин отпадает, какое-то направленное действие тоже. При этом, прионные заболевания имеет больший объем, один прион меняет кучу других белков, которые в свою очередь становятся прионами. Пример - болезнь Альцгеймера, там и APP белок, Тау белок, ,DOPEY2 белок, дофига. 

[Аристотель]

4 часа назад, Loiso Pondohva сказал:

Я понимаю, что в плане селективности можно не мудрствовать лукаво, а использовать природный механизм активации профермента в нужном месте. Но как сделать это именно там, где нам надо? Нужен какой-то маркер приона, а этот маркер ещё привязать к триггеру для активации фермента (через кофермент, или отщепление куска цепи). 

Чтобы такое делать, нужно уметь предсказывать конформацию белка, а это пока не очень хорошо научились делать. В общем, идея пока не очень перспективная, нужно многое изучить о прионов, а потом уже думать над лечением. 

[фосолиф-кимих]

23.08.2020 в 20:28, Loiso Pondohva сказал:

Добрый день
И снова не совсем адекватные, но интересные вопросы. Как известно, лекарства от прионов ещё не придумали, хотя есть некоторые сподвижки в виде антител итд. 
Но прионы обладают невероятной химической стойкостью в силу своего строения. β-структуры все дела. Поэтому они стойки и к расщеплению большинством человеческих ферментов. Но что, если взять самую хоть сколько-то работающую протеазу, и подвергнуть её направленной эволюции? (Ну я имею ввиду той, за которую давеча нобелевку дали. Кучу раз мутируем фермент, замеряем активность, отбираем штаммы с наибольшей, снова мутируем...). Есть ли шансы через много поколений действительно получить работающий на прионы фермент? И тогда такой вопрос. Селективность протеаз. Они, насколько я знаю, несмотря на много типов, сильной выборочностью не отличаются к сожалению. Максимум их "селективности" - это расщепление до олигомеров, по определённой последовательности. Есть ли шанс сесть на 2 стула, и получить ещё и не опасную для тела протеазу? Или если оно будет хорошо расщеплять прионы, оно 100% будет расщеплять и всё остальное. Какие есть идеи по обходу этой проблемы?
//Вопрос чисто на порассуждать и подумать какие тут подводные камни и почему так ещё правда не делают, что можно улучшить и вообще надо ли. 

Соотвествующие протеазы есть в пророщенном горохе. Бобовые запасают аминокислоты в семенах в виде амилоидных белков.

[Loiso Pondohva]

28.08.2020 в 10:31, фосолиф-кимих сказал:

Соотвествующие протеазы есть в пророщенном горохе. Бобовые запасают аминокислоты в семенах в виде амилоидных белков.

Здравая мысль, благодарю! 
Я сейчас немного завален, так что тему не развиваю, хотя, как будет время, почитаю по теме побольше, набросаю новые варианты.