химические рекорды

[chemister2010]

 

В 26.12.2024 в 20:02, ZZZ7ZZZ сказал:

А что потом с этими 34350-ти символами делать? Сохранить - понятно.

 

Убрать лишние символы (нумерацию аминокислот, пробелы).

Потом заменить однобуквенный код на названия остатков аминокислот.

https://kodomo.fbb.msu.ru/~youthofchemist/projects/Term_1/AminoAcid/index.html

Например, A - это аланил, R - аргинил, E - глутамил, Q - глутаминил и т.д.

После 20 замен получится русское название аминокислотной последовательности титина. Только в последней аминокислоте надо будет окончание не -ил, а -ин сделать.

Если заморочится серьезнее, то можно еще вставить все фосфорилированные остатки аминокислот (там есть таблица ниже последовательности). Можно упростить работу если задача  просто посчитать число букв - можно просто пересчитать сколько было фосфорилировано аминокислот и число букв в слове фосфо (5) умножить на число фосфорилированных остатков и добавить к полученному результату для аминокислот.

Изменено 26 Декабря, 2024 в 17:21 пользователем chemister2010

[yatcheh]

В 26.12.2024 в 20:10, chemister2010 сказал:

 

 

Убрать лишние символы (нумерацию аминокислот, пробелы).

Потом заменить однобуквенный код на названия остатков аминокислот.

https://kodomo.fbb.msu.ru/~youthofchemist/projects/Term_1/AminoAcid/index.html

Например, A - это аланил, R - аргинил, E - глутамил, Q - глутаминил и т.д.

После 20 замен получится русское название аминокислотной последовательности титина. Только в последней аминокислоте надо будет окончание не -ил, а -ин сделать.

Если заморочится серьезнее, то можно еще вставить все фосфорилированные остатки аминокислот (там есть таблица ниже последовательности).

 

Ну всё, дело в шляпе!

[chemister2010]

В принципе можно сделать расчет брутто-формулы, хотя это сложнее.

 

Если компьютер очень мощный, можно даже сгенерировать химическое название 1 хромосомы человека. Но там 248 миллионов пар нуклеотидов и размер файла будет в гигабайтах. Это будет самое длинное русское слово сгенерированное человеком.

[ZZZ7ZZZ]

В 26.12.2024 в 23:10, chemister2010 сказал:

Например, A - это аланил, R - аргинил

В таблице все на -ин

Плюс две кислоты из двух слов.

[yatcheh]

В 26.12.2024 в 20:17, chemister2010 сказал:

В принципе можно сделать расчет брутто-формулы, хотя это сложнее.

 

Если компьютер очень мощный, можно даже сгенерировать химическое название 1 хромосомы человека. Но там 248 миллионов пар нуклеотидов и размер файла будет в гигабайтах. Это будет самое длинное русское слово сгенерированное человеком.

 

Фигня, и это можно сделать. Ничего тут особо мощного тут не надо. 

[chemister2010]

В 26.12.2024 в 20:20, ZZZ7ZZZ сказал:

В таблице все на -ин

Плюс две кислоты из двух слов.

 

Там нужно -ин заменить на -ил, кроме 2 исключений: глутимин меняется на глутаминил, аспарагин меняется на аспарагинил. Это из-за того, что у глутаминовой кислоты как раз глутамил, а у аспарагиновой кислоты аспарагил.

В 26.12.2024 в 20:22, yatcheh сказал:

 

Фигня, и это можно сделать. Ничего тут особо мощного тут не надо. 

 

Не все компы и программы могут работать с текстовыми файлами в 5-10 Гб. Даже файловые системы глючат при таких объемах.

[ZZZ7ZZZ]

В 26.12.2024 в 23:24, chemister2010 сказал:

Там нужно -ин заменить на -ил

поправь, чтоб точно не пролететь.
A Аланин
R Аргинин
N Аспарагин
D Аспарагиновая кислота
V Валин
H Гистидин
G Глицин
Q Глутамин
E Глутаминовая кислота
I Изолейцин
L Лейцин
K Лизин
M Метионин
P Пролин
S Серин
Y Тирозин
T Треонин
W Триптофан
F Фенилаланин
V Цистеин

[chemister2010]

A Аланил
R Аргинил
N Аспарагинил
D Аспартил
V Валил
H Гистидил
G Глицил
Q Глутаминил
E Глутамил
I Изолейцил
L Лейцил
K Лизил
M Метионил
P Пролил
S Серил
Y Тирозил
T Треонил
W Триптофил
F Фенилаланил
V Цистеинил

В 26.12.2024 в 20:33, ZZZ7ZZZ сказал:

поправь, чтоб точно не пролететь.

 

Сделал табличку

[yatcheh]

В 26.12.2024 в 20:24, chemister2010 сказал:

 

Там нужно -ин заменить на -ил, кроме 2 исключений: глутимин меняется на глутаминил, аспарагин меняется на аспарагинил. Это из-за того, что у глутаминовой кислоты как раз глутамил, а у аспарагиновой кислоты аспарагил.

 

Не все компы и программы могут работать с текстовыми файлами в 5-10 Гб. Даже файловые системы глючат при таких объемах.

 

Так аспарагил, или аспартил?

 

10Гб - фигня. Я шифратор делал, так он 40-гигабайтные файлы двухпроходным алгоритмом только так щёлкал. 

[chemister2010]

В 26.12.2024 в 20:52, yatcheh сказал:

 

Так аспарагил, или аспартил?

 

10Гб - фигня. Я шифратор делал, так он 40-гигабайтные файлы двухпроходным алгоритмом только так щёлкал. 

 

Согласно белой книге ИЮПАК все-таки аспартил.