Медицинская химия

[alexmarlboro]

Как полагаю, вопрос больше относится к органике, чем к фармацевтической химии, поэтому пишу сюда. Еще со школы мечтал заниматься разработкой лекарственных препаратов, и почему-то думал, что этим занимаются биологи, и поступил на биологию. Ныне заканчиваю 1 курс магистратуры, и занимаюсь какой-то чушью, не имеющей отношения к изначальным моим планам. Все идет криво. Как сейчас понял, биологам в подавляющем большинстве случаев в этом деле отведена скромная роль в тестировании препаратов на биологическим моделях. В самом лучшем случае - изыскание биологических мишеней методами протеомики и геномики. А вот на уровне химии работают именно химики, как правило органики - конструирование молекулы лекарства, адекватной мишени - чисто химическая задача. Так получилось, что у меня единственный путь теперь - аспирантура в нынешнем месте, в другое место меня не возьмут по ряду причин. Если теоретически, защититься мне по специальности "биохимия", или "биотехнология", чтобы хотя б немного химией "пахло" - далее податься (хоть как-нибудь, на подхвате сначала потрудиться, даже забесплатно) к соответствующим товарищам-химикам, работающим в околомедицинской тематике, будет толк? Интересует компьютерное моделирование лекарственных соединений, ну и синтез. Или все это глупости, и не стоит мечтать. Кто что думает?

[chemister2010]

Если вы захотите этого добиться - то добьетесь. Подайте заявление на аспирантуру куда вы хотите и убедите своего научного руководителя в ваших знаниях и интересе к вопросу, и все у вас будет.

[Korenev]

Как полагаю, вопрос больше относится к органике, чем к фармацевтической химии, поэтому пишу сюда. Еще со школы мечтал заниматься разработкой лекарственных препаратов, и почему-то думал, что этим занимаются биологи, и поступил на биологию. Ныне заканчиваю 1 курс магистратуры, и занимаюсь какой-то чушью, не имеющей отношения к изначальным моим планам. Все идет криво. Как сейчас понял, биологам в подавляющем большинстве случаев в этом деле отведена скромная роль в тестировании препаратов на биологическим моделях. В самом лучшем случае - изыскание биологических мишеней методами протеомики и геномики. А вот на уровне химии работают именно химики, как правило органики - конструирование молекулы лекарства, адекватной мишени - чисто химическая задача. Так получилось, что у меня единственный путь теперь - аспирантура в нынешнем месте, в другое место меня не возьмут по ряду причин. Если теоретически, защититься мне по специальности "биохимия", или "биотехнология", чтобы хотя б немного химией "пахло" - далее податься (хоть как-нибудь, на подхвате сначала потрудиться, даже забесплатно) к соответствующим товарищам-химикам, работающим в околомедицинской тематике, будет толк? Интересует компьютерное моделирование лекарственных соединений, ну и синтез. Или все это глупости, и не стоит мечтать. Кто что думает?

Разработкой лекарств занимается целая команда исследователей, в ней и химики, и биологи, и даже физики подчас имеются. Компьютерным моделированием занимаются фармакологи. А вот куда отнести фармакологию вообще не понятно. В смысле к химии или к биологии? 

В этом смысле биохимия куда ближе к фармакологии, нежели органическая химия.

Так что, на мой взгляд, специальность "биохимия" вам вполне поможет.

Вот только с разработкой новых лекарств в России весьма плохо, если что и разрабатывают, то новый арбидол, либо копируют западные оригинальные препараты. С российскими оригинальными лекарствами огромная проблема, нет их вообще.

[Vimto]

Как полагаю, вопрос больше относится к органике, чем к фармацевтической химии, поэтому пишу сюда. Еще со школы мечтал заниматься разработкой лекарственных препаратов, и почему-то думал, что этим занимаются биологи, и поступил на биологию. Ныне заканчиваю 1 курс магистратуры, и занимаюсь какой-то чушью, не имеющей отношения к изначальным моим планам. Все идет криво. Как сейчас понял, биологам в подавляющем большинстве случаев в этом деле отведена скромная роль в тестировании препаратов на биологическим моделях. В самом лучшем случае - изыскание биологических мишеней методами протеомики и геномики. А вот на уровне химии работают именно химики, как правило органики - конструирование молекулы лекарства, адекватной мишени - чисто химическая задача. Так получилось, что у меня единственный путь теперь - аспирантура в нынешнем месте, в другое место меня не возьмут по ряду причин. Если теоретически, защититься мне по специальности "биохимия", или "биотехнология", чтобы хотя б немного химией "пахло" - далее податься (хоть как-нибудь, на подхвате сначала потрудиться, даже забесплатно) к соответствующим товарищам-химикам, работающим в околомедицинской тематике, будет толк? Интересует компьютерное моделирование лекарственных соединений, ну и синтез. Или все это глупости, и не стоит мечтать. Кто что думает?

Скажем так, если у вас есть желание заниматься синтезом или обсчетом каких-то потенциально полезных соединений, то этим заняться можно. Только чем-то одним: или синтезом, или расчетами, одновременно - на грани фантастики. Но при этом вы должны изначально отдавать себе отчет в том, что эта полезность и значимость останется только на бумаге/в вашей лаборатории и пр., т. е. практического применения как такового не будет. Даже если вы синтезируете что-то с хорошими свойствами, то сделать с этим практически ничего невозможно, так как у наших НИИ нет денег на углубленные испытания. Второй вариант - это договориться с какими-то западными фармацевтическими компаниями, но это тоже сложно/долго/малоприбыльно и т. д.

Из личного опыта также могу сказать, что к расчетам и расчетчикам в России отношение весьма скептическое и даже пренебрежительное. Возможно это из-за того, что органики и расчетчики понимают друг друга с большим трудом. На западе все по-другому, если ведется исследование с практической значимостью, то все структуры предварительно считают, а только потом синтезируют. Нам до этого еще очень далеко.

[tixmir]

Не надо говорить, что нам до чего-то далеко. К примеру, я в своем дипломе все соединения считал, а потом синтезировал.

По поводу лекарств. Чем именно Вы хотите заниматься? Опишу как они создаются. Итак, на создание одного нового лекарственного препарата сейчас уходит, в среднем, больше 10 лет и сотни миллионов, если не миллиарды долларов.  Поэтому в слаборазвитых странах типа России никакими разработками не занимаются, у наших компаний на это нет ни денег, ни желания, ведь никто не знает, что будет в России через 10 лет. Разработки ведутся на западе фирмами типа Байера, Новартиса и тп Естественно, что занимаются этими вещами не отдельные люди, а большие научные коллективы, в которые входят и биологи, и химики, и программисты и еще много кого. Обычно разработка выглядит так, берется какое-то исходное вещество, оно может быть природным, а может быть исскуственно расчитано на компьютере (для этого надо выделить фермент-мишень, определить его трехмерную структуру, найти там активный центр, и спроектировать комплиментарную молекулу). Далее на основе этой исходной структуры синтезируется библиотека соединений ( несколько тысяч веществ незначительно отличающихся друг от друга). Как правило эту библиотеку делает либо машина (если все соединения делаются одинаково, по однотипным реакциям), либо дешевые индуские, китайские или российские химики. Затем эти соединения испытываются на клеточных культурах, выращенных в чашках петри ( это делают уже биологи), отбираются несколько сотен кандидатов. Затем испытания на мышках, несколько десятков кандидатов, на приматах или свинках, несколько кандидатов. Ну и на людях, сначала на здоровых взрослых мужчинах, затем на больных ( двоякослепое плацебоконтролируемое исследование, проводят врачи). И только потом в продажу ( о в-ве узнают фармацевты). Так где в этой цепочке хотите работать ВЫ?

Изменено 22 Июня, 2015 в 23:25 пользователем tixmir

[alexmarlboro]

Если вы захотите этого добиться - то добьетесь. Подайте заявление на аспирантуру куда вы хотите и убедите своего научного руководителя в ваших знаниях и интересе к вопросу, и все у вас будет.

В том и дело что в аспирантуру я могу пойти только на свою кафедру, из-за ряда причин, которые перечислять здесь нет смысла. В рамках своей кафедры самое лучшее - аспирантура по специальности биохимия/молекулярная биология/ биотехнология. Поэтому, если не будет никаких форсмажоров, через 5 лет я буду к.б.н. Собственно с этого момента и начинается мой вопрос - могу ли я, уде будучи к.б.н. перетечь каким-то образом в сферу конструирования лекарственных препаратов, именно на уровне химии? Потому как времени в 5 лет (1 магистратуры+4 года аспы) вполне достаточно для параллельного освоения в свободное время означенной мною научной сферы.

Не надо говорить, что нам до чего-то далеко. К примеру, я в своем дипломе все соединения считал, а потом синтезировал.

По поводу лекарств. Чем именно Вы хотите заниматься? Опишу как они создаются. Итак, на создание одного нового лекарственного препарата сейчас уходит, в среднем, больше 10 лет и сотни миллионов, если не миллиарды долларов.  Поэтому в слаборазвитых странах типа России никакими разработками не занимаются, у наших компаний на это нет ни денег, ни желания, ведь никто не знает, что будет в России через 10 лет. Разработки ведутся на западе фирмами типа Байера, Новартиса и тп Естественно, что занимаются этими вещами не отдельные люди, а большие научные коллективы, в которые входят и биологи, и химики, и программисты и еще много кого. Обычно разработка выглядит так, берется какое-то исходное вещество, оно может быть природным, а может быть исскуственно расчитано на компьютере (для этого надо выделить фермент-мишень, определить его трехмерную структуру, найти там активный центр, и спроектировать комплиментарную молекулу). Далее на основе этой исходной структуры синтезируется библиотека соединений ( несколько тысяч веществ незначительно отличающихся друг от друга). Как правило эту библиотеку делает либо машина (если все соединения делаются одинаково, по однотипным реакциям), либо дешевые индуские, китайские или российские химики. Затем эти соединения испытываются на клеточных культурах, выращенных в чашках петри ( это делают уже биологи), отбираются несколько сотен кандидатов. Затем испытания на мышках, несколько десятков кандидатов, на приматах или свинках, несколько кандидатов. Ну и на людях, сначала на здоровых взрослых мужчинах, затем на больных ( двоякослепое плацебоконтролируемое исследование, проводят врачи). И только потом в продажу ( о в-ве узнают фармацевты). Так где в этой цепочке хотите работать ВЫ?

Скорее всего, именно расчетчиком. Насколько понимаю, тут кроме органики, еще необходимы знания квантовой и физической химии. Все, что касается физики и математики я усваиваю довольно неплохо, так что думаю, что у меня получилось бы. Синтезом было бы, конечно тоже интересно заниматься, но раз тут говорят, что это затруднительно совмещать, то лучше именно компьютерная часть, потому как руки у меня кривые. 

Разработкой лекарств занимается целая команда исследователей, в ней и химики, и биологи, и даже физики подчас имеются. Компьютерным моделированием занимаются фармакологи. А вот куда отнести фармакологию вообще не понятно. В смысле к химии или к биологии? 

В этом смысле биохимия куда ближе к фармакологии, нежели органическая химия.

Так что, на мой взгляд, специальность "биохимия" вам вполне поможет.

Вот только с разработкой новых лекарств в России весьма плохо, если что и разрабатывают, то новый арбидол, либо копируют западные оригинальные препараты. С российскими оригинальными лекарствами огромная проблема, нет их вообще.

Вот как раз-таки фармакология мне неинтересна. Это очень широкое понятие. Словосочетание "медицинская химия" лучше характеризует то, чем бы я планировал заниматься, в недалеком будущем. Насчет биохимии... это тоже очень широкое понятие. И биохимиками себя называют все, кому не лень. Биохимия (ну и мол.биология) в контексте фармакологии - это изучение метаболических путей, сигнальных путей, мишеней для терапевтического воздействия, возможно, расшифровка структуры этих мишеней (как правило, рецепторов и ферментов). Меня же, конкретно, конструирование лекарственных структур интересует.

[Korenev]

Вот как раз-таки фармакология мне неинтересна. Это очень широкое понятие. Словосочетание "медицинская химия" лучше характеризует то, чем бы я планировал заниматься, в недалеком будущем. Насчет биохимии... это тоже очень широкое понятие. И биохимиками себя называют все, кому не лень. Биохимия (ну и мол.биология) в контексте фармакологии - это изучение метаболических путей, сигнальных путей, мишеней для терапевтического воздействия, возможно, расшифровка структуры этих мишеней (как правило, рецепторов и ферментов). Меня же, конкретно, конструирование лекарственных структур интересует.

А как вы собираетесь конструировать лекарственные структуры без знаний фармакологии, т.е. без знаний мишеней, метаболических путей и прочего (т.е. фармакодинамики). Т.е., например, просто наобум подставляя всевозможные заместители в бензольном или триазольном кольцах молекулы того же флуконазола? Так ничего не получится. 

Изменено 25 Июня, 2015 в 14:20 пользователем Korenev

[alexmarlboro]

А как вы собираетесь конструировать лекарственные структуры без знаний фармакологии, т.е. без знаний мишеней, метаболических путей и прочего (т.е. фармакодинамики). Т.е., например, просто наобум подставляя всевозможные заместители в бензольном или триазольном кольцах молекулы того же флуконазола? Так ничего не получится. 

Да нет же)) я не против знания фармакологии, и биохимии (в чем я, к слову, некоторую компетенцию имею, будучи биологом). Я к тому, чтобы заниматься именно конструированием лекарств, как химик, в том числе и опираясь на фармакологические знания.

[Korenev]

Да нет же)) я не против знания фармакологии, и биохимии (в чем я, к слову, некоторую компетенцию имею, будучи биологом). Я к тому, чтобы заниматься именно конструированием лекарств, как химик, в том числе и опираясь на фармакологические знания.

Непосредственно конструированием новых лекарств занимается фармаколог. Т.е. то что вы описали - первоначальное компьютерное моделирование структуры новой молекулы лекарства - это дело рук фармаколога. 

[alexmarlboro]

Непосредственно конструированием новых лекарств занимается фармаколог. Т.е. то что вы описали - первоначальное компьютерное моделирование структуры новой молекулы лекарства - это дело рук фармаколога. 

У Вас, возможно, не совсем точное понимание деятельности фармаколога. Вообще, под этим понятием в широком смысле понимают много кого - начиная от расчетчиков и синтетиков, заканчивая врачами-клиницистами, проводящими испытания. Но обычно - это люди с биологическим, медицинским, либо высшим фармацевтическим образованием. Я потрудился (на лаборантской должности, правда) пару лет в НИИ фармакологии, там все фармакологи, но поверьте, люди и школьную химию/физику так себе знают, не говорю уже о каком-то компьютерном моделировании. Не исключаю, что есть "фармакологи", занимающиеся этим, но в большинстве это не так. По моему обзору этой темы, и общению с людьми, этим занимаются либо химики (обычно органики) со скиллом в квантах, либо, реже - околобиологический люд - биофизики, биоинформатики, со скиллом в химии.