Посмотрел Ваш сайт, идея хорошая, но еще сырая. По мойму,В первую очередь нужно сделать фильтр, который отметает( если не синонимы,это в идеале), то хотя бы копии, особо актуально для вектона( я вводил бензол). Еще, было бы неплохо прилепить рисовалку формул, типа вот http://www.sigmaaldrich.com/catalog/search/substructure/SubstructureSearchPage , исходная рисовалка это фрисофт. И сделать поиск по cas номерам, в вектоне это есть.