Химические программы (химический софт)

[chemister2010]

Существуют ли современные компьютерные программы для планирования синтеза вещества? Программы для расчета скорости реакции по структуре?

[ash111]

В 14.11.2025 в 21:36, chemister2010 сказал:

программы для планирования синтеза вещества?

какие то были, но я так понимаю не взлетели. Химические базы данных типа реаксиса и сайфайндера их благополучно похоронили. Вполне закономерно - потому что для многих процессов недостаточно знать, что реакция возможна, нужно понимать насколько хорошо она идет. Химический процесс не происходит в сферическом вакууме, там есть куча входящих факторов, которые могут поменять результат на противоположный. Поэтому правильное программное планирование - это когда есть большая база, и из нее части цепочки собираются в общий синтез. Реаксис нуу в принципе это реализует, хотя там все равно придется самому ручками по частям это все собирать. Если такое считается.. то значит можно сказать что есть. Но там интеллекта минимум, только база.

 

В 14.11.2025 в 21:36, chemister2010 сказал:

Программы для расчета скорости реакции по структуре?

Такие реакции, для которых можно посчитать скорость по структуре, никому вообще не интересны, потому что это примитив. Как только становится чтото посложнее в структуре и условиях, то там уже невозможно ничего посчитать с какойлибо уверенностью.

И опять же, кому нужна эта скорость? нужна принципиальная реакционная способность, а ускорить даже если не удастся то это все равно издержки. Ну а для реакционной способности есть базы.

 

Серьезно, сколько работаю на всяких проектах, ни один заказчик, ни один менеджер, никто никогда не упоминал чтото подобное. Расчет структуры под мишень - да, поиск по базам - постоянно, свои наработки - тоже часто, а какието планирующие программы - ни разу никто не предлагал применить.

[Almonax]

Насколько я вижу литературу, обычно это апостериорная работа. То есть могло свариться 4 разных вещества, а получили как продукт только одно - тогда начинаются расчеты барьеров реакций, учет сольватационных эффектов и прочее. В обратную сторону сделать это проблематично - слишком много считать придется, всяких возможных и невозможных вариантов.

В целом же, если интересует может/не может так быть, а литературных источников нет - можно квантово-химически обсчитать механизм, и уже из термодинамических величин делать выводы. 

В 14.11.2025 в 22:36, chemister2010 сказал:

Программы для расчета скорости реакции по структуре?

В целом, относительные скорости реакции считаются. Как пример, ссылка на туториал Орки - https://www.faccts.de/docs/orca/6.0/tutorials/react/actibar.html

[chemister2010]

Странно, что в Справочнике химика за 1965 год есть расчет кинетики реакций по константам Гаммета и Тафта, а в современности такого нет. 

[Almonax]

В 15.11.2025 в 15:31, chemister2010 сказал:

Странно, что в Справочнике химика за 1965 год есть расчет кинетики реакций по константам Гаммета и Тафта, а в современности такого нет

Так ничего удивительного - они крайне приближенные. Для каких-то простых, хорошо исследованных систем, да работают. А суешься во что-то новое - все ломается. Если для своих систем субстрат/растворитель найдете константы для уравнений, то оценка вполне себе неплохая.

[St2Ra3nn8ik]

В 15.11.2025 в 12:31, chemister2010 сказал:

Странно, что в Справочнике химика за 1965 год есть расчет кинетики реакций по константам Гаммета и Тафта, а в современности такого нет. 

 

В 15.11.2025 в 18:01, Almonax сказал:

Так ничего удивительного - они крайне приближенные.

Вот тут пишут, что их смогли доработать и сделать точнее. Там и ссылка (doi) на исследование есть. Если недоступна, то ищите как обычно - через сцы-хуб.