Перейти к содержанию
Форум химиков на XuMuK.ru

Покритикуйте, пожалуйста, нашу бесплатную базу на пол миллиарда конформеров


igorchem

Рекомендуемые сообщения

Решение задач, рефераты, курсовые! Онлайн сервис помощи учащимся. Цены в 2-3 раза ниже!

Добрый день,

предлагаю Вашему вниманию предварительный релиз базы данных химических веществ с поиском по функциональным группам, на данный момент в ней 103 миллиона молекул и около 500 миллионов конформеров, которая основана на данных PubChem и которую мы планируем сами дополнять новыми данными и расчетами.

https://www.elegant-nmr.com/mdb/

Мы планируем эту базу всегда поддерживать бесплатно у нас на сайте.

С радостью выслушаю критику, замечания, отзывы, советы.

Спасибо!

С уважением и с наступающими Новогодними праздниками!

Ссылка на комментарий
2 минуты назад, igorchem сказал:

Добрый день,

предлагаю Вашему вниманию предварительный релиз базы данных химических веществ с поиском по функциональным группам, на данный момент в ней 103 миллиона молекул и около 500 миллионов конформеров, которая основана на данных PubChem и которую мы планируем сами дополнять новыми данными и расчетами.

https://www.elegant-nmr.com/mdb/

Мы планируем эту базу всегда поддерживать бесплатно у нас на сайте.

С радостью выслушаю критику, замечания, отзывы, советы.

Спасибо!

С уважением и с наступающими Новогодними праздниками!

Видать база очень интересная))) Я понимаю что тором зайти можно, но делать я этого конечно же не буду.

178322895_.png.d5ee9e9d51a20468c4767b4cafa58826.png

Ссылка на комментарий

Спасибо большое за ответ!

 

Прикольно, не знал, что у вас так билайн поступает. Скажите, пожалуйста, мне очень интересно, а другие провайдеры тоже так блокируют?

 

Спасибо!

Изменено пользователем igorchem
Ссылка на комментарий
9 часов назад, igorchem сказал:

Спасибо большое за ответ!

 

Прикольно, не знал, что у вас так билайн поступает. Скажите, пожалуйста, мне очень интересно, а другие провайдеры тоже так блокируют?

 

Спасибо!

Скорее всего да, с телефона тоже не заходит (МТС). Судя по всему сайт заблокирован Роскомнадзором, так что не рассчитывайте на трафик из России. 

Изменено пользователем Вадим Вергун
Ссылка на комментарий

Не понял цели вашей базы данных.

Не понял почему у вас NMR в названии. Это как-то связано с ЯМР-спектрами?

Неудобно, что атомы в формуле нужно отделять пробелами.

В хелпе для Functional groups опечатка в первом слове.

Ссылка на комментарий

Кликаю на значки "вопрос" - ничего не происходит. Поле ввода "Only CID" не редактируется.

Что ж так всё криво?

Изменено пользователем yatcheh
Ссылка на комментарий

Кривенько, открылось, но дальше ничего. Вопрос работает только первый с задержкой в 2-3 секунды

На запрос C18H36 выдало нечто фантастические из чистого углерода, целых 3 штуки1!!красиво, но бессмысленно

Ссылка на комментарий

Спасибо большое за отзывы, в старом варианте надо было разделять пробелами группы атомов, сейчас исправил.

 

Ключевая идея при поиске - это вначале выбрать те функциональные группы, что есть в молекуле для поиска, и потом сделать такой поиск.

Например, мы хотим найти все, что содержит COOH, CH3, NH2 группы и имеет не много атомов.

В этом случае вводим поочередно в Auxilary Search


1. COOH , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 54723866,
2. CH3 , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 3034819,
3. NH2 , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 5460608,

Теперь мы хотим найти молекулы, которые содержат эти функциональные группы (в Functional Groups у нас из-за вспомогательного поиска осталось 54723866,3034819,59342537) , причем мы хотим найти молекулы, у которых есть от 2 до 8 атомов углерода и от 1 до 5 атомов фтора, тогда в первой строке мы запишем:

C2-8 F1-5

и нажимаем поиск.

Получается 11 молекул. У тех, у которых есть конформеры, при переключении на конформеры Вы можете мышкой повернуть и посмотреть на молекулу с разных сторон.

Ссылка на комментарий

Для публикации сообщений создайте учётную запись или авторизуйтесь

Вы должны быть пользователем, чтобы оставить комментарий

Создать учетную запись

Зарегистрируйте новую учётную запись в нашем сообществе. Это очень просто!

Регистрация нового пользователя

Войти

Уже есть аккаунт? Войти в систему.

Войти
  • Последние посетители   0 пользователей онлайн

    • Ни одного зарегистрированного пользователя не просматривает данную страницу
×
×
  • Создать...
Яндекс.Метрика