Перейти к публикации
Форум химиков на XuMuK.ru

Покритикуйте, пожалуйста, нашу бесплатную базу на пол миллиарда конформеров


Рекомендованные сообщения

Решение задач, рефераты, курсовые - онлайн сервис помощи учащимся. Цены в 2-3 раза ниже!

Добрый день,

предлагаю Вашему вниманию предварительный релиз базы данных химических веществ с поиском по функциональным группам, на данный момент в ней 103 миллиона молекул и около 500 миллионов конформеров, которая основана на данных PubChem и которую мы планируем сами дополнять новыми данными и расчетами.

https://www.elegant-nmr.com/mdb/

Мы планируем эту базу всегда поддерживать бесплатно у нас на сайте.

С радостью выслушаю критику, замечания, отзывы, советы.

Спасибо!

С уважением и с наступающими Новогодними праздниками!

Ссылка на сообщение
2 минуты назад, igorchem сказал:

Добрый день,

предлагаю Вашему вниманию предварительный релиз базы данных химических веществ с поиском по функциональным группам, на данный момент в ней 103 миллиона молекул и около 500 миллионов конформеров, которая основана на данных PubChem и которую мы планируем сами дополнять новыми данными и расчетами.

https://www.elegant-nmr.com/mdb/

Мы планируем эту базу всегда поддерживать бесплатно у нас на сайте.

С радостью выслушаю критику, замечания, отзывы, советы.

Спасибо!

С уважением и с наступающими Новогодними праздниками!

Видать база очень интересная))) Я понимаю что тором зайти можно, но делать я этого конечно же не буду.

178322895_.png.d5ee9e9d51a20468c4767b4cafa58826.png

Ссылка на сообщение

Спасибо большое за ответ!

 

Прикольно, не знал, что у вас так билайн поступает. Скажите, пожалуйста, мне очень интересно, а другие провайдеры тоже так блокируют?

 

Спасибо!

Изменено пользователем igorchem
Ссылка на сообщение
9 часов назад, igorchem сказал:

Спасибо большое за ответ!

 

Прикольно, не знал, что у вас так билайн поступает. Скажите, пожалуйста, мне очень интересно, а другие провайдеры тоже так блокируют?

 

Спасибо!

Скорее всего да, с телефона тоже не заходит (МТС). Судя по всему сайт заблокирован Роскомнадзором, так что не рассчитывайте на трафик из России. 

Изменено пользователем Вадим Вергун
Ссылка на сообщение

Не понял цели вашей базы данных.

Не понял почему у вас NMR в названии. Это как-то связано с ЯМР-спектрами?

Неудобно, что атомы в формуле нужно отделять пробелами.

В хелпе для Functional groups опечатка в первом слове.

Ссылка на сообщение

Кликаю на значки "вопрос" - ничего не происходит. Поле ввода "Only CID" не редактируется.

Что ж так всё криво?

Изменено пользователем yatcheh
Ссылка на сообщение

Кривенько, открылось, но дальше ничего. Вопрос работает только первый с задержкой в 2-3 секунды

На запрос C18H36 выдало нечто фантастические из чистого углерода, целых 3 штуки1!!красиво, но бессмысленно

Ссылка на сообщение

Спасибо большое за отзывы, в старом варианте надо было разделять пробелами группы атомов, сейчас исправил.

 

Ключевая идея при поиске - это вначале выбрать те функциональные группы, что есть в молекуле для поиска, и потом сделать такой поиск.

Например, мы хотим найти все, что содержит COOH, CH3, NH2 группы и имеет не много атомов.

В этом случае вводим поочередно в Auxilary Search


1. COOH , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 54723866,
2. CH3 , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 3034819,
3. NH2 , выбираем Import to Main Search, тогда в Functional Groups добавляется CID номер 5460608,

Теперь мы хотим найти молекулы, которые содержат эти функциональные группы (в Functional Groups у нас из-за вспомогательного поиска осталось 54723866,3034819,59342537) , причем мы хотим найти молекулы, у которых есть от 2 до 8 атомов углерода и от 1 до 5 атомов фтора, тогда в первой строке мы запишем:

C2-8 F1-5

и нажимаем поиск.

Получается 11 молекул. У тех, у которых есть конформеры, при переключении на конформеры Вы можете мышкой повернуть и посмотреть на молекулу с разных сторон.

Ссылка на сообщение

Присоединяйтесь к обсуждению

Вы можете опубликовать сообщение сейчас, а зарегистрироваться позже. Если у вас есть аккаунт, войдите в него для написания от своего имени.
Примечание: вашему сообщению потребуется утверждение модератора, прежде чем оно станет доступным.

Гость
Ответить в тему...

×   Вставлено в виде отформатированного текста.   Вставить в виде обычного текста

  Разрешено не более 75 эмодзи.

×   Ваша ссылка была автоматически встроена.   Отобразить как ссылку

×   Ваш предыдущий контент был восстановлен.   Очистить редактор

×   Вы не можете вставить изображения напрямую. Загрузите или вставьте изображения по ссылке.

Загрузка...
  • Сейчас на странице   0 пользователей

    Нет пользователей, просматривающих эту страницу.

×
×
  • Создать...
Яндекс.Метрика